Der Inhalt des Studiums ist in Module, d. h. in thematisch und zeitlich abgerundete, in sich abgeschlossene Einheiten, aufgeteilt. Die meisten Module umfassen vier Semesterwochenstunden und fünf ECTS-Punkte und enthalten einen Übungs- oder einen Laboranteil. Zum Ende des Semesters wird in jedem Modul eine Prüfungsleistung erbracht. Nicht bestandene Prüfungen können in der Regel im darauf folgenden Semester wiederholt werden. Es gibt auch Module, die sich über zwei Semester erstrecken.

Das Grundstudium ist entsprechend dem interdisziplinären Charakter breit angelegt und für die beiden Studiengänge Mechatronik und Medizintechnik gleich, sodass nach dem Grundstudium noch die Möglichkeit zum Wechsel besteht, sofern im 3. Semester des angestrebten Studiengangs Studienplätze frei sind.

Das Hauptstudium besteht aus Pflicht-, Vertiefungs-, Wahlpflicht- und WISO-Modulen (wirtschaftlich-sozialer Bereich). Dazu kommen eine Projektarbeit, das praktische Studiensemester und die Bachelorarbeit.

Die drei Vertiefungsrichtungen bestehen jeweils aus sechs Vertiefungsmodulen, überwiegend mit Laboranteilen. Die Erarbeitung dieser Vertiefungsmodule erstreckt sich über vier Semester. Diese Module werden in der Regel einmal jährlich angeboten. Die Entscheidung für eine Vertiefungsrichtung muss der Studierende aber nicht im 3. Semester treffen, sie kann beliebig im Laufe seines Hauptstudiums erfolgen. Nicht "genutzte" Vertiefungsmodule können als Wahlpflichtmodule angerechnet werden. Die Angabe der Vertiefungsrichtung im Bachelor-Zeugnis ist optional.